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Sample-derived cDNA guides broad host RNA depletion for in vivo pathogen transcriptomics
该研究提出了一种利用样本来源的 cDNA 引导 RNase H 介导的宿主 RNA 特异性降解方法，在保留细菌 rRNA 作为体内生物标志物的同时，显著富集了细菌转录本并大幅降低了体内病原体转录组测序的成本与深度需求。
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307 篇论文
分子生物学探索着生命的核心密码，揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论，而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science，我们致力于打破学术壁垒，让这些前沿发现触手可及。
本栏目收录的所有预印本均源自 bioRxiv。我们团队会逐一处理该分类下发布的最新预印本，为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与详尽的技术摘要，无论您是专业研究者还是科学爱好者，都能轻松掌握核心发现。
以下是该领域最新发布的预印本论文列表，欢迎浏览探索。
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Differential chromatin looping regulated by two GA-binding transcription factors creates an X-specific chromatin environment for dosage compensation
该研究揭示，GA 结合转录因子 CLAMP 通过在 X 染色体活性区域竞争性取代 GAF，特异性地介导短程染色质环以连接剂量补偿复合物结合位点与活跃基因，从而构建出 X 染色体特有的染色质环境以实现剂量补偿。
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ApoFLARE: a luminescent reporter for direct quantification of APOBEC3A editing activity
该研究开发了一种名为 ApoFLARE 的基因编码发光报告系统，能够将 APOBEC3A 介导的胞嘧啶脱氨活性转化为定量发光信号，从而实现对活细胞中 A3A 编辑活性的时间分辨、可扩展及异质性分析。
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Transcription directs Holliday junction branch migration
该研究揭示转录通过驱动拓扑异构酶 Top3 介导的 Holliday 连接体向共凝聚蛋白结合位点的定向迁移，从而在减数分裂中引导交叉重组的精确发生与染色体分离。
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Conservation of extended sequence and structure in the branchpoint-to-3' splice site region upstream of neural microexons
该研究通过比较人类与鸡的神经微外显子，发现其分支点与 3'剪接位点之间具有高度保守的序列和特殊的 RNA 二级结构（即该区域高度可及且未配对），这种结构特征可能通过缓解空间位阻并促进 SRRM4 等调控因子的结合，从而协助解决微外显子因尺寸过小而面临的剪接识别难题。
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In garden dormouse cerebral cortex, specific transcriptional programs exist for all major phases of hibernation
该研究通过对林睡鼠大脑皮层进行转录组测序，揭示了其在冬眠周期中（特别是从深冬眠向苏醒过渡阶段）存在高度特异性的基因表达重编程，涉及代谢抑制、氧化还原稳态及蛋白质处理等关键通路，并在苏醒期表现出与冬眠进程相反的转录逆转机制，从而维持神经组织的完整性。
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Molecular mechanism of coilin interaction with core snRNPs
该研究揭示了 Cajal 体支架蛋白 coilin 通过其 C 末端包含 RG 重复序列的非特异性 RNA 结合区以及识别 Sm 蛋白的类 Tudor 结构域，特异性地结合并筛选未成熟的 snRNP，从而阐明了 coilin 在 Cajal 体中执行 snRNP 组装质量控制及隔离缺陷复合物的分子机制。
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Large-scale mutational analysis uncovers molecular mechanisms governing dual RNA functions in transposons
该研究通过大规模突变分析揭示了 IS 转座子（IStron）中 RNA 结构稳定性是决定其转座、RNA 引导的 DNA 切割与自我剪接这三种功能之间权衡与选择的关键分子机制。
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MEF2A is a negative regulator of β-Cell maturation and function
该研究揭示转录因子 MEF2A 是内质网应激诱导的β细胞功能障碍的关键负调控因子，其表达上调会抑制β细胞成熟基因并损害胰岛素分泌，而抑制 MEF2A 则有助于维持β细胞功能。
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CRISPR screens establish regulatory maps of immunosuppressive surface molecules in cancer
该研究利用可诱导的 CRISPR 筛选技术绘制了多种免疫抑制性表面分子的调控图谱，并发现膜运输因子 DNAJC13 是 PD-L1 和 CD276 的关键调控者，其抑制可增强 T 细胞对癌细胞的杀伤力并延长胰腺癌小鼠的生存期。